More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3052 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  258  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  48.41 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  45.08 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  45.79 
 
 		 205 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.74 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  44.54 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  42.62 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  39.05 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  35.2 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  35.2 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  35.77 
 
 		 500 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  38.37 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  32.41 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.64 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.24 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>