More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2884 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  99.19 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  87.1 
 
 		 124 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  68.29 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  64.46 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  63.64 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  60.83 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  59.5 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  60.33 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 132 aa  94  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 142 aa  83.6  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 		 500 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  27.42 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  36.89 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  29.63 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  33.98 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  32.32 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>