More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4692 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  249  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  45 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  40.16 
 
 		 480 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  37.01 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  40.5 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  40.21 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  32.32 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  32.32 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.94 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1144  putative endoribonuclease, translationalinhibitor protein  37.27 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5003  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  37 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  37.61 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  33.63 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  35.05 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>