More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2891 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  55.08 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  52.46 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  54.03 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  52.83 
 
 		 205 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  46.03 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  94  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  49.59 
 
 		 480 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  37.61 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  43.64 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  44.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  35.77 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 500 aa  77  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  39.18 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  41.24 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  38.74 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  33.88 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.23 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.54 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.23 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>