More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0836 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  269  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.62 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  35.34 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  34.86 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  32.43 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  30.97 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.97 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  29.46 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  34.26 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  26.55 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  34.45 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  36.94 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.48 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  29.46 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  29.91 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  29.91 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.04 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  34.45 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  31.25 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>