More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0674 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 394 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  42.06 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.29 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.43 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.45 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.45 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  28.3 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.47 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.8 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  29.2 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  28.32 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  27.03 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  26.8 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  43.28 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  32.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  37.96 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  27.35 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.85 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  37.66 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  33.57 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.69 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  31.13 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  36.36 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  29.25 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>