276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3905 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 164 aa  343  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  36.11 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 394 aa  68.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  36.72 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5133  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81404  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 130 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  32.73 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  32.14 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  29.17 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.59 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.59 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  21.85 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  25.66 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  28.68 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  32.46 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 128 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  26.32 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  25.26 
 
 		 127 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 125 aa  51.2  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  25.26 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 124 aa  51.2  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  27.37 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  29.57 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  30.49 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.68 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  27.2 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  26.13 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  27 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  24.75 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  24.75 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>