More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3231 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  56.45 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  62.61 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  56.41 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  64.36 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  52.59 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  51.69 
 
 		 480 aa  97.1  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  44.26 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  46.73 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  37.17 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  33.05 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  33.05 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  35.43 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  40.21 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.77 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.26 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  33.03 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>