More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1985 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  100 
 
 		 480 aa  948    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1528  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.162616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0767  aldo/keto reductase  44.48 
 
 		 336 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0712  aldo/keto reductase  35.88 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000693877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1982  aldo/keto reductase family protein  41.61 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.454617 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42373  predicted protein  35.8 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71632  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08658  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31589  predicted protein  35.15 
 
 		 239 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231835  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  30.59 
 
 		 327 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  104  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  51.69 
 
 		 130 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0494  aldo/keto reductase  34.15 
 
 		 318 aa  97.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 132 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 343 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 321 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 335 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 343 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  31.76 
 
 		 326 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  27.48 
 
 		 314 aa  90.9  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 331 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 346 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  30.91 
 
 		 354 aa  90.1  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  30.65 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  30.64 
 
 		 331 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  30.24 
 
 		 334 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  30.72 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  30.36 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  31.52 
 
 		 350 aa  89.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  31.62 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 128 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  31.62 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 132 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  33.18 
 
 		 346 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  31.83 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 315 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  30.17 
 
 		 326 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  31.79 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  33.18 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  33.18 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 128 aa  87.8  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  33.18 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  31.23 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  31.51 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  31.23 
 
 		 346 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  30.98 
 
 		 344 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 129 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 309 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  30.04 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  30.04 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  30.04 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.9 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  30.04 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  30.04 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 327 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  29.93 
 
 		 332 aa  86.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  31.56 
 
 		 346 aa  86.7  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  27.55 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  30.07 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  46.56 
 
 		 122 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  31.63 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 127 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  31.73 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  30.55 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  28.24 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  30.89 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  32.35 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3082  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0228208  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4579  aldo/keto reductase  30.07 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00601  aldo/keto reductase  25.5 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  30.98 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  32.71 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  32.9 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  33.95 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  45.8 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  45.8 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  30.34 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  30.28 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  33.92 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_002936  DET0217  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.75 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  29.37 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  28.87 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  27.63 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.79 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5157  hypothetical protein  28.23 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 133 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.79 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  32.6 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  33.22 
 
 		 343 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00621  aldo/keto reductase  25.17 
 
 		 320 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  31.64 
 
 		 360 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.58 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  28.47 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.55 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  29.75 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>