179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1710 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 121 aa  247  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  81.36 
 
 		 132 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  82.2 
 
 		 121 aa  203  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  82.2 
 
 		 121 aa  203  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  45.83 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  38.94 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  35.48 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  35.77 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  33.87 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  37.25 
 
 		 480 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  31.53 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  34.56 
 
 		 500 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  32.99 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  30 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  31.86 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  23.21 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  25.98 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  23.44 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  25.69 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>