More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4381 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  256  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  64.17 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  62.2 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  60.83 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  60.83 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  46.77 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  44.72 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  37.19 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  36.76 
 
 		 500 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  39.34 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  32.11 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  30.43 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  30.08 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  30.08 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  34.55 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  27.52 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>