More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2457 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  263  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  72.03 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  69.75 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  68.33 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  68.07 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  68.07 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  62.4 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  58.46 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  62.7 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  62.04 
 
 		 205 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  56.52 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  45.05 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  40.5 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  43.09 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  38.4 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  38.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  40 
 
 		 480 aa  68.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.94 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.28 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  37.18 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  36.04 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  43.02 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.78 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  38.75 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  37.89 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  40.24 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>