More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0282 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  52.85 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  56.03 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  49.18 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 133 aa  110  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  56.6 
 
 		 205 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  47.15 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  37.86 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 204 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 204 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  39.52 
 
 		 204 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 204 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  39.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  45.76 
 
 		 480 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.04 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  34.13 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.19 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  36.03 
 
 		 500 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.96 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.11 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>