More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1439 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  276  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  69.67 
 
 		 135 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  47.58 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  46.23 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  42.62 
 
 		 480 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  40.16 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 		 500 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  36.59 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  36.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.88 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.33 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  34.86 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  38.04 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  33.03 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  33.64 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  36.7 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  33.94 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  33.94 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>