More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1925 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  265  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  99.21 
 
 		 127 aa  265  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  60.8 
 
 		 137 aa  176  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  59.68 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  44.53 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  45.53 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  34.71 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  32.54 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.78 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  32.8 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.78 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  32.26 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  25.4 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  31.48 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  34.23 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  31.53 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  29.09 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  30.4 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>