More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2335 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  248  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  46.03 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  44.35 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 205 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  48.31 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  41.13 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  41.32 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.53 
 
 		 480 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  38.35 
 
 		 500 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.36 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 204 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  30.16 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  36.04 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  30.16 
 
 		 204 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 204 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  29.58 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  27.52 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.04 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>