208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1109 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  41.28 
 
 		 207 aa  90.1  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  40.37 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  40.37 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  31.78 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  31.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  31.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  31.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  32.03 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  31.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  31.01 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  31.01 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  31.25 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  32.03 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  32.56 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  30.85 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  31.37 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  28.85 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  30.48 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  29.7 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  27.83 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  26.42 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>