More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3519 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
131 aa  273  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  83.85 
 
 
132 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  81.4 
 
 
129 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  80.62 
 
 
129 aa  223  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  81.4 
 
 
131 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  81.4 
 
 
131 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  81.4 
 
 
131 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 
129 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  80.62 
 
 
131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  80.62 
 
 
131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  80.62 
 
 
131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  80.62 
 
 
131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  81.4 
 
 
132 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 
131 aa  218  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  79.84 
 
 
131 aa  218  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 
130 aa  216  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 
135 aa  216  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 
130 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  75.19 
 
 
132 aa  206  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  67.69 
 
 
140 aa  189  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  62.02 
 
 
134 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 
108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 
136 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 
129 aa  160  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 
132 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 
131 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 
129 aa  158  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  58.91 
 
 
132 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 
134 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  57.36 
 
 
134 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 
130 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
132 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 
132 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 
132 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 
132 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 
130 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
137 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
137 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
137 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
137 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
137 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  39.06 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 
137 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.96 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  35.96 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  35.96 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  92.11 
 
 
38 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  41.84 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  41.05 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  37.39 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 
402 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  38.89 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 
129 aa  57.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 
125 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  38.14 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  26.45 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.63 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  30.7 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>