33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1661 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  97.37 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 38 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  92.11 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  86.84 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  86.84 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  89.47 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  86.84 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  89.47 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  86.84 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  86.84 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  81.58 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  81.58 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  76.32 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  78.95 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  63.64 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  60.61 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  59.46 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  54.05 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  57.58 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>