More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0130 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  270  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  80.62 
 
 		 132 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  76.92 
 
 		 131 aa  214  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  76.92 
 
 		 131 aa  214  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  77.52 
 
 		 131 aa  215  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  76.92 
 
 		 131 aa  214  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  76.15 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  76.15 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  76.74 
 
 		 129 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  76.74 
 
 		 132 aa  212  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  76.15 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  76.15 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  76.74 
 
 		 129 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  75.38 
 
 		 131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  75.38 
 
 		 131 aa  210  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 135 aa  205  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  72.87 
 
 		 140 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  70.54 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  64.34 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  63.85 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  63.85 
 
 		 134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  62.79 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  62.31 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  60.47 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 134 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  75.27 
 
 		 108 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  38.6 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  38.6 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  38.6 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  34.85 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  81.58 
 
 		 38 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  38.26 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  36.04 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.78 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.38 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.04 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>