More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1433 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  260  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  41.82 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  37.27 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  37.27 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  37.27 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00590  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  34.23 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239835  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.91 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  29.37 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  31.78 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.04 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.9 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>