More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0376 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  82.22 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  72.18 
 
 		 140 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  66.43 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  65.44 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 145 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  63.97 
 
 		 145 aa  186  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  64.18 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  65.67 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  62.41 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  64.93 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  65.67 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  63.24 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  63.24 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  63.97 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 137 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  63.43 
 
 		 144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  63.43 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  66.42 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  62.41 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  60.14 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  59.42 
 
 		 138 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  61.03 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.73 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  37.84 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  39.45 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  31.82 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  38.32 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  41.28 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  40.74 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.27 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  36.7 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  40.74 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  41.82 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  45.88 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.74 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.96 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  37.27 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.74 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  42.06 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.94 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  30.91 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>