More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3227 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  71.85 
 
 		 137 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  75.74 
 
 		 140 aa  213  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  72.18 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  66.91 
 
 		 149 aa  193  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  65.94 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  65.94 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  64.03 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  65.44 
 
 		 145 aa  190  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  65.44 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  62.32 
 
 		 136 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  63.77 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  62.86 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  63.24 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  59.42 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  58.7 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 145 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  60.29 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  61.03 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.63 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  35.96 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  35.9 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  38.66 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  36.13 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  27.54 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  36.94 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.62 
 
 		 402 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  36.47 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4068  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611141  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  30.63 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  30.22 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  34.12 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  30.63 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>