More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4466 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  79.85 
 
 		 137 aa  226  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  78.2 
 
 		 136 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  61.65 
 
 		 132 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  63.85 
 
 		 131 aa  173  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  65.41 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  62.88 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  63.16 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  59.4 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  58.65 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  56.82 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  55.3 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  52.99 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  54.14 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  54.14 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  57.25 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  49.24 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  52.24 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  51.49 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  48.09 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  48.51 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  31.06 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.89 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  37.86 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  37.86 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  36.54 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  32.84 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  34.19 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  37.61 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  31.58 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  34.62 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  28.87 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>