More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3169 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  86.15 
 
 		 130 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  85.38 
 
 		 130 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  85.38 
 
 		 130 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  60.47 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  60.94 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  60.94 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  63.16 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  58.46 
 
 		 132 aa  167  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  59.38 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  60.15 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  60.47 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  55.04 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  29.23 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  33.07 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  32.35 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.2 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.06 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.06 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  34.07 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  28.95 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  28.07 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  31.03 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>