More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0498 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  74.02 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  71.32 
 
 		 132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  61.72 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  59.69 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  59.4 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  59.23 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  58.46 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  58.91 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  59.52 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  54.89 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  54.14 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 133 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  35.16 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  39.06 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  34.68 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  34.43 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  35.54 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.43 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  38.18 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  35.48 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  35.24 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>