More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0673 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  46.15 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  36.28 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  46.15 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  41.9 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  39.42 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  39.42 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.44 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  44.23 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  39.82 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  37.21 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.45 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.61 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  41.35 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  42.31 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.17 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.64 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>