More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3867 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  54.7 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  49.59 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  34.21 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.14 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  37.37 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  32.46 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  32.46 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.95 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  33.96 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  31.58 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  37.29 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  24.19 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  31.58 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  38.94 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  29.27 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  27.56 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>