More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2061 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  48.46 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.05 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  36.52 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.51 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.82 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  57  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  26.23 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.98 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  32.99 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  27.35 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  29.37 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  34.91 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  27.2 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  30.43 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  33.62 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.98 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0887  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 421 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  29.63 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  26.83 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>