252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5523 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  269  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  93.18 
 
 		 132 aa  254  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  93.18 
 
 		 132 aa  254  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  93.18 
 
 		 132 aa  254  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  90.91 
 
 		 132 aa  249  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  27.87 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  25.81 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  31.09 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  25.81 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  26.02 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  28.57 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  26.26 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  29.69 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  23.97 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  25.86 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  27.36 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  28.69 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  24.39 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  25.78 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  21.54 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  27.12 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  27.12 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  27.35 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  24.76 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  25.23 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  26.92 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  26.23 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  35.06 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  26.4 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  25.76 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  24.22 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  25.76 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  25.4 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  24.22 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  25.6 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  24.79 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  24.22 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  24.81 
 
 		 402 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  25.78 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  24.39 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  24.27 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  27.37 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  25.78 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  21.09 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  27.45 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  21.95 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  25.83 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  30.21 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>