More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0414 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  89.81 
 
 		 133 aa  195  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  60.19 
 
 		 128 aa  128  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  61.11 
 
 		 142 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 122 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 122 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 122 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  64.36 
 
 		 130 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  61.11 
 
 		 133 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 118 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  56.6 
 
 		 128 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  55.14 
 
 		 138 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  57.01 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  52.83 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 132 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 127 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 131 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 127 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  48.57 
 
 		 129 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 127 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  51.46 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  38.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  34.68 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  36.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 134 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  43.4 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  38 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  49.53 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 124 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  45.35 
 
 		 480 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.43 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36.27 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  29.79 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.48 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 125 aa  62  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  28.72 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  30.26 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  31.48 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  34.38 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>