More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1171 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  34.55 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  37.04 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.96 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.96 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  43.88 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.19 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.19 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  35.85 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.58 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>