More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1855 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  294  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  47.1 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  48.91 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  46.72 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  46.72 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  45.26 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  47.45 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  46.72 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  45.26 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  40.43 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  36.7 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  26.45 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  31.82 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  34.86 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  38.55 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  35.19 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.99 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  39.51 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.59 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  36.7 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  38.55 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>