202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2305 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  287  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.71 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  33.62 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  39.36 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 394 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  33.56 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  34.26 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  27.82 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  35.85 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  35.85 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  27.21 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  26.28 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  38.04 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  31.51 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  30.93 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.35 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  33.06 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  29.57 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 131 aa  47.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  29.75 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.35 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.63 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  32.53 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.4 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  27.35 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  30.97 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  30.97 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 204 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  34.91 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  34.83 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 375 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  36.45 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  33.73 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>