137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1292 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 375 aa  772    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2220  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  30.05 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  27.36 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  31.25 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  27.08 
 
 		 129 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  28.78 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  30.86 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  26.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  28.38 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  42.53 
 
 		 149 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  27.06 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  30.21 
 
 		 130 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 432 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  27.08 
 
 		 128 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  34.48 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 138 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 134 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  34 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  34 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 133 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  27.08 
 
 		 127 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 139 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 136 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 145 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  28.7 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  37.36 
 
 		 140 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  26.04 
 
 		 130 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 130 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 132 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  31.29 
 
 		 140 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  30.53 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  30.61 
 
 		 140 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 143 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  26.04 
 
 		 128 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  30.61 
 
 		 140 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 138 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 140 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 145 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 127 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 133 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 133 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 130 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 136 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 138 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  37.18 
 
 		 129 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 129 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  28.05 
 
 		 143 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.34 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 135 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 125 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  35.35 
 
 		 126 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  29.59 
 
 		 136 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  31.37 
 
 		 128 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  27.97 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 131 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 124 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  23.74 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  25.98 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 127 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  28.92 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  26.91 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  36.47 
 
 		 140 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  27.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  27.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  26.01 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  24.41 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 118 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  25 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>