230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1188 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 175 aa  347  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  51.7 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  51.02 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 142 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  41.56 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 137 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  40.43 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 		 151 aa  94.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  34.01 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  30.46 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.07 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  31.29 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  27.03 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.04 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  30.07 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.86 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  30.5 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  30.14 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.82 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  34.03 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 133 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 127 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 149 aa  50.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  31.01 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 580 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  30.87 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  26.47 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  33.93 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 127 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  31.21 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  30.67 
 
 		 129 aa  47.8  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 128 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 137 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>