188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2176 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  58.91 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  43.61 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 142 aa  97.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  34.67 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.16 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.16 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  26.55 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.34 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  24.14 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 510 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  28.1 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  26.02 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  24.17 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  22.61 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  27.52 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  26.89 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  25.62 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>