More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2689 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  62.31 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  57.03 
 
 		 131 aa  157  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  52.99 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  53.08 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  146  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  54.76 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  54.33 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.4 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.96 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.75 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.06 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.06 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.87 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  30.89 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.46 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  31.67 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  33.66 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  27.5 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>