More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0958 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  248  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  72.95 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  63.2 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  61.6 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 128 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  63.2 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  58.87 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  41.35 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  42.62 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  39.76 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  37.37 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  38.52 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  38.55 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  35.19 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  44.05 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  31.86 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  34.51 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 387 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  34.11 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>