More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2280 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  268  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  62.31 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  60.77 
 
 		 131 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  58.46 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  61.42 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  58.46 
 
 		 130 aa  167  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 134 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  58.78 
 
 		 131 aa  166  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  57.03 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  56.15 
 
 		 130 aa  163  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  56.35 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  53.38 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  53.38 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 134 aa  130  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  44.27 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  36.44 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  39.37 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.09 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.66 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  39.62 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  38.39 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  33.9 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  35.19 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.82 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  29.82 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 125 aa  57  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  33.04 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>