205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3706 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  33.91 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  35.2 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  35.2 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.14 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  37.35 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  26.02 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  31.82 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  23.97 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 		 510 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  32.81 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  30.71 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  29.9 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  30.77 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  31.63 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  33.67 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 394 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  39.73 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  29.63 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  26.19 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  26.19 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>