140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2385 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  64.57 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  39.22 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  26.89 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 392 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.89 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.21 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  35.4 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  26.05 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.05 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  23.33 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  25.21 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  25.21 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  29.29 
 
 		 118 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  34.91 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.58 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.64 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  29.66 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  31.96 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  27.27 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  31.96 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  24.77 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  38.18 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  27.27 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  29.82 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  24.77 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  32.1 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>