More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2843 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  255  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.05 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.03 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  32.48 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  29.69 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  35.42 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  33.93 
 
 		 207 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  25.98 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  24.81 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  24.81 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  24.81 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  29.46 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.04 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>