241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3363 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  31.15 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  37.61 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.83 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  34.59 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  35.23 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  34.33 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  34.33 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 		 510 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 394 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  31.85 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  27.41 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>