More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0853 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  85.94 
 
 		 128 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  92.19 
 
 		 128 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  79.07 
 
 		 129 aa  217  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  79.84 
 
 		 129 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  59.2 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  66.12 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  65.29 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  63.87 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  44.35 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  40.16 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  44.72 
 
 		 480 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  37.19 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  39.26 
 
 		 500 aa  68.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  37.65 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  35.43 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  36.07 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>