More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2862 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  41.09 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.77 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  38.33 
 
 		 480 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  32.23 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.5 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  30.48 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.84 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  30.84 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  31.13 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  30.84 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  28.07 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.52 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  27.68 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  28.97 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.72 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>