More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2499 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  257  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  41.54 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  36.36 
 
 		 402 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  34.74 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  31.25 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  37.93 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.03 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 394 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  27.62 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  30.53 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  32 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.9 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  28.42 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  38.4 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.85 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  36.79 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  29.47 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>