More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4894 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3975  hypothetical protein  36.69 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.123478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1859  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  35.71 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  37.7 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  34.51 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  37.63 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  32.73 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  32.73 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.5 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  36.19 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  32.8 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.99 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 394 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  34.41 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  36.52 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>