More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6837 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  79.26 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  79.26 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  79.26 
 
 		 137 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  69.63 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  72.59 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  69.63 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  68.18 
 
 		 138 aa  189  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  60.77 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  37.01 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  41.07 
 
 		 207 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  41.6 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  41.6 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  40.18 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  40.18 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  48.75 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  34.62 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  35.2 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  36.54 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  37.07 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 173 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.18 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>