152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3087 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  61.76 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09338  L-PSP endoribonuclease family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03420)  41.74 
 
 		 192 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.920057 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  36.57 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07059  conserved hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  35.51 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.94 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  33.83 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  36.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  36.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  29.71 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  32.17 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  33.9 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  31.03 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  31.93 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  31.93 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  30 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  32.23 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 171 aa  47.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  29.91 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  32.76 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  31.03 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  30.94 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  42.86 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>